引起股權轉讓撤銷權糾紛的原因有：
1、一方以欺詐手段，使對方在違背真實意思的情況下訂立了股權轉讓協議；
2、一方或者第三人以脅迫手段，使對方在違背真實意思的情況下訂立了股權轉讓協議；
3、當事人基于重大誤解訂立了股權轉讓協議。法律依據：《中華人民共和國民法典》第一百四十七條 基于重大誤解實施的民事法律行為，行為人有權請求人民法院或者仲裁機構予以撤銷。 第一百四十八條 一方以欺詐手段，使對方在違背真實意思的情況下實施的民事法律行為，受欺詐方有權請求人民法院或者仲裁機構予以撤銷。 第一百四十九條 第三人實施欺詐行為，使一方在違背真實意思的情況下實施的民事法律行為，對方知道或者應當知道該欺詐行為的，受欺詐方有權請求人民法院或者仲裁機構予以撤銷。 第一百五十條 一方或者第三人以脅迫手段，使對方在違背真實意思的情況下實施的民事法律行為，受脅迫方有權請求人民法院或者仲裁機構予以撤銷。