計算土地增值稅的方法是：增值額×適用稅率=（收入-稅法允許扣除項目）×適用稅率。土地增值稅按照納稅人轉讓房地產所取得的增值額向取得收入的單位和個人征收，增值額未超過扣除項目金額20%的不需要繳納土地增值稅。法律依據：《土地增值稅暫行條例》第二條 轉讓國有土地使用權、地上的建筑物及其附著物（以下簡稱轉讓房地產）并取得收入的單位和個人，為土地增值稅的納稅義務人（以下簡稱納稅人），應當依照本條例繳納土地增值稅。 第三條 土地增值稅按照納稅人轉讓房地產所取得的增值額和本條例第七條規定的稅率計算征收。 第四條 納稅人轉讓房地產所取得的收入減除本條例第六條規定扣除項目金額后的余額，為增值額。 第八條 有下列情形之一的，免征土地增值稅： （一）納稅人建造普通標準住宅出售，增值額未超過扣除項目金額20%的； （二）因國家建設需要依法征用、收回的房地產。