發生宅基地使用權糾紛的解決方式是：首先可以雙方進行協商；協商不成的可以請求鄉人民政府解決；對鄉人民政府的處理決定不服的可以向人民法院起訴。在土地房屋爭議解決前，任何一方都不可以對房屋進行變動。法律依據：《民法典》第二百三十三條 物權受到侵害的，權利人可以通過和解、調解、仲裁、訴訟等途徑解決。 《中華人民共和國土地管理法》第十六條 土地所有權和使用權爭議，由當事人協商解決；協商不成的，由人民政府處理。 單位之間的爭議，由縣級以上人民政府處理；個人之間、個人與單位之間的爭議，由鄉級人民政府或者縣級以上人民政府處理。 當事人對有關人民政府的處理決定不服的，可以自接到處理決定通知之日起三十日內，向人民法院起訴。 在土地所有權和使用權爭議解決前，任何一方不得改變土地利用現狀。