丟失房產契稅單可以申請補辦，本人應攜帶身份證原件到行政審批中心的契稅窗口查詢歷史繳納記錄，到市級報社登報申明遺失后憑報紙與身份證件開具契稅繳納證明。法律依據：《契稅法》第十一條　 納稅人辦理納稅事宜后，稅務機關應當開具契稅完稅憑證。納稅人辦理土地、房屋權屬登記，不動產登記機構應當查驗契稅完稅、減免稅憑證或者有關信息。未按照規定繳納契稅的，不動產登記機構不予辦理土地、房屋權屬登記。 《稅收征收管理法》第二十一條 稅務機關是發票的主管機關，負責發票印制、領購、開具、取得、保管、繳銷的管理和監督。單位、個人在購銷商品、提供或者接受經營服務以及從事其他經營活動中，應當按照規定開具、使用、取得發票。發票的管理辦法由國務院規定。