丟失購房發票第二聯的，依然可以辦理房產證。購房者可以率先到房屋所在地的稅務部門申請代開不動產統一銷售票據，或者向住建局說明情況，到銀行打印流水、開具證明，亦可證明房屋買賣事實關系。法律依據：《不動產登記暫行條例》第十三條　 不動產登記簿由不動產登記機構永久保存。不動產登記簿損毀、滅失的，不動產登記機構應當依據原有登記資料予以重建。行政區域變更或者不動產登記機構職能調整的，應當及時將不動產登記簿移交相應的不動產登記機構。 《稅收征收管理法》第二十一條 稅務機關是發票的主管機關，負責發票印制、領購、開具、取得、保管、繳銷的管理和監督。單位、個人在購銷商品、提供或者接受經營服務以及從事其他經營活動中，應當按照規定開具、使用、取得發票。發票的管理辦法由國務院規定。