工程竣工驗收合格后，進行結算如下：驗收合格后乙方匯總整理所有結算資料，上報監理及甲方；監理審核結算資料的完整性，核對達成一致甲方匯報結算情況，經同意簽發書面意見；乙方提出結算付款申請，甲方主管領導交財務付款。

法律依據

《建設工程價款結算暫行辦法》第十四條

單項工程竣工后，承包人應在提交竣工驗收報告的同時，向發包人遞交竣工結算報告及完整的結算資料，發包人應按以下規定時限進行核對（審查）并提出審查意見。工程竣工結算報告金額審查時間：

（一）1500萬元以下，從接到竣工結算報告和完整的竣工結算資料之日起20天；

（二）2500萬元-2000萬元，從接到竣工結算報告和完整的竣工結算資料之日起30天；

（三）32000萬元-5000萬元，從接到竣工結算報告和完整的竣工結算資料之日起45天；

（四）45000萬元以上，從接到竣工結算報告和完整的竣工結算資料之日起60天。