工程款糾紛適用專屬管轄。工程款糾紛屬于建設工程合同糾紛之一，一般以被告住所地或者合同履行地即工程所在地為管轄地，可以按照不動產(chǎn)糾紛確定管轄。

法律依據(jù)：

《民事訴訟法》第二十三條

因合同糾紛提起的訴訟，由被告住所地或者合同履行地人民法院管轄。

第三十三條

下列案件，由本條規(guī)定的人民法院專屬管轄：

（一）因不動產(chǎn)糾紛提起的訴訟，由不動產(chǎn)所在地人民法院管轄；

（二）因港口作業(yè)中發(fā)生糾紛提起的訴訟，由港口所在地人民法院管轄；

（三）因繼承遺產(chǎn)糾紛提起的訴訟，由被繼承人死亡時住所地或者主要遺產(chǎn)所在地人民法院管轄。

第三十四條

合同或者其他財產(chǎn)權益糾紛的當事人可以書面協(xié)議選擇被告住所地、合同履行地、合同簽訂地、原告住所地、標的物所在地等與爭議有實際聯(lián)系的地點的人民法院管轄，但不得違反本法對級別管轄和專屬管轄的規(guī)定。