公司亂罰款可以投訴的部門有勞動行政部門，也可以向勞動仲裁委員會申請仲裁。根據(jù)法律規(guī)定，勞動者認為用人單位侵犯其勞動保障合法權(quán)益的，有權(quán)向勞動保障行政部門投訴。

法律依據(jù)：

《勞動保障監(jiān)察條例》第九條

任何組織或者個人對違反勞動保障法律、法規(guī)或者規(guī)章的行為，有權(quán)向勞動保障行政部門舉報。

勞動者認為用人單位侵犯其勞動保障合法權(quán)益的，有權(quán)向勞動保障行政部門投訴。

勞動保障行政部門應(yīng)當為舉報人保密；對舉報屬實，為查處重大違反勞動保障法律、法規(guī)或者規(guī)章的行為提供主要線索和證據(jù)的舉報人，給予獎勵。

《中華人民共和國勞動爭議調(diào)解仲裁法》第五條

發(fā)生勞動爭議，當事人不愿協(xié)商、協(xié)商不成或者達成和解協(xié)議后不履行的，可以向調(diào)解組織申請調(diào)解；不愿調(diào)解、調(diào)解不成或者達成調(diào)解協(xié)議后不履行的，可以向勞動爭議仲裁委員會申請仲裁；對仲裁裁決不服的，除本法另有規(guī)定的外，可以向人民法院提起訴訟。