保函主體的選擇需要從以下幾方面入手：

第一，選擇資質信用良好的發包人。投標前承包人需多方搜集發包人信息，做好投標前的盡職調查，切忌盲目投標;

第二，選擇適格保函擔保人。保函擔保人可以是在國內注冊的有資格的銀行、專業擔保公司、保險公司。適格的保函擔保人能夠提供規范的保函業務，盡到應有的審核義務;

第三，杜絕工程掛靠或轉包行為。工程掛靠或轉包是違反法律規定的無效行為，使保函主體關系復雜化，將會帶來無盡的法律風險。

法律依據:

《招標投標法》

第46條第2款：招標文件要求中標人提交履約保證金的，中標人應當提交。

《建設工程施工合同》

第41條：發包人承包人為了全面履行合同，應互相提供以下擔保：發包人向承包人提供履約擔保，按合同約定支付工程價款;承包人向發包人提供履約擔保，按合同約定履行自己的各項義務。