行政機關在行政訴訟時候，在理論上以及地方的實踐案例中可以做原告。行政訴訟是個人、法人或其他組織認為行政主體以及法律法規(guī)授權的組織作出的行政行為侵犯其合法權益而向法院提起的訴訟。行政訴訟是訴訟的一種有效方法。行政訴訟法是規(guī)范行政訴訟活動和訴訟法律關系的法律規(guī)范的總稱。它是規(guī)定法院、訴訟當事人以及其他訴訟參與人進行訴訟活動，及其在訴訟活動中形成的訴訟法律關系的法律規(guī)范。行政訴訟是一種訴訟程序法，主要是確定訴訟參加人的法律地位和相互關系的法律規(guī)范。

《中華人民共和國行政訴訟法》第二十五條　 行政行為的相對人以及其他與行政行為有利害關系的公民、法人或者其他組織，有權提起訴訟。 有權提起訴訟的公民死亡，其近親屬可以提起訴訟。 有權提起訴訟的法人或者其他組織終止，承受其權利的法人或者其他組織可以提起訴訟。 人民檢察院在履行職責中發(fā)現(xiàn)生態(tài)環(huán)境和資源保護、食品藥品安全、國有財產保護、國有土地使用權出讓等領域負有監(jiān)督管理職責的行政機關違法行使職權或者不作為，致使國家利益或者社會公共利益受到侵害的，應當向行政機關提出檢察建議，督促其依法履行職責。行政機關不依法履行職責的，人民檢察院依法向人民法院提起訴訟。