公司合并清算組在清算期間主要有以下職權：
1、清理公司財產；
2、編制資產負債表和財產清單；
3、通知、公告債權人；
4、處理與清算有關的公司未了結的業務；
5、清繳所欠稅款以及清算過程中產生的稅款；
6、清理債權、債務；處理公司清償債務后的剩余財產；
7、代表公司參與民事訴訟活動等。法律依據：《中華人民共和國公司法》第一百八十四條 清算組在清算期間行使下列職權： （一）清理公司財產，分別編制資產負債表和財產清單； （二）通知、公告債權人； （三）處理與清算有關的公司未了結的業務； （四）清繳所欠稅款以及清算過程中產生的稅款； （五）清理債權、債務； （六）處理公司清償債務后的剩余財產； （七）代表公司參與民事訴訟活動。