經濟適用房分兩種，經濟適用房管理的房子，一般就是集資建房或者是回遷房，也就是常說的二類經濟適用房，交易的時候買方出3%的土地出讓金。另外一種就是經濟適用房立項的房子，比如北京的回龍觀、天通苑、通惠家園等等，批地的時候就是按照經濟適用房審批的，這種房屋必須滿5年才能交易，交易的時候要繳納10%的綜合地價款，如果房本上面加蓋了方形章，寫著按經濟適用房管理，那就是3%的土地出讓金商品房是不用交土地出讓金的，回遷房里面可能會有一部分商品房，是因為原房主被拆遷的房子是私房，所以回遷后也不是按照回遷房給的，而是按照商品房處理的，所以商品房是不用交這個3%的，不過這種幾率很小。

《中華人民共和國土地管理法》 第二條 中華人民共和國實行土地的社會主義公有制，即全民所有制和勞動群眾集體所有制。 全民所有，即國家所有土地的所有權由國務院代表國家行使。 任何單位和個人不得侵占、買賣或者以其他形式非法轉讓土地。土地使用權可以依法轉讓。 國家為了公共利益的需要，可以依法對土地實行征收或者征用并給予補償。 國家依法實行國有土地有償使用制度。但是，國家在法律規定的范圍內劃撥國有土地使用權的除外。