長期股權投資破產清算應該按下列方式進行處理：
1、自法院發布受理上市公司破產案件的公告當日起，交易所對進入破產程序；
2、公司應在收到法院有關法律文書的當日，立即向交易所報告，經交易所審查后公告；
3、法院依法宣告上市公司破產。法律依據：《中華人民共和國公司法》第一百八十六條 清算組在清理公司財產、編制資產負債表和財產清單后，應當制定清算方案，并報股東會、股東大會或者人民法院確認。 公司財產在分別支付清算費用、職工的工資、社會保險費用和法定補償金，繳納所欠稅款，清償公司債務后的剩余財產，有限責任公司按照股東的出資比例分配，股份有限公司按照股東持有的股份比例分配。 第一百九十條 公司被依法宣告破產的，依照有關企業破產的法律實施破產清算。 第一百八十七條 清算組在清理公司財產、編制資產負債表和財產清單后，發現公司財產不足清償債務的，應當依法向人民法院申請宣告破產。 公司經人民法院裁定宣告破產后，清算組應當將清算事務移交給人民法院。