質量保證金的扣留手續，主要有兩種：

1、逐次扣留，即發包人在支付工程進度款時按比例逐次扣留;

2、一次性扣留，即發包人在工程竣工結算時一次性扣留質量保證金。

法律依據:

1、《建設工程質量保證金管理暫行辦法》第二條規定：本辦法所稱建設工程質量保證金(保修金)(以下簡稱保證金)是指發包人與承包人在建設工程承包合同中約定，從應付的工程款中預留，用以保證承包人在缺陷責任期內對建設工程出現的缺陷進行維修的資金。

2、第九條 缺陷責任期內，承包人認真履行合同約定的責任，到期后，承包人向發包人申請返還保證金。

3、第十條 發包人在接到承包人返還保證金申請后，應于14日內會同承包人按照合同約定的內容進行核實。如無異議，發包人應當在核實后14日內將保證金返還給承包人，逾期支付的，從逾期之日起，按照同期銀行貸款利率計付利息，并承擔違約責任。發包人在接到承包人返還保證金申請后14日內不予答復，經催告后14日內仍不予答復，視同認可承包人的返還保證金申請。