1、兩者責任主體不同。停工留薪是《工傷保險條例》規定的一個概念，責任主體是用人企業，指職工因工作遭受事故傷害或者患職業病需要暫停工作接受工傷醫療的，在停工留薪期內，原工資、薪水、福利、保險等待遇不變，由所在單位按月支付。而誤工費是針對侵權人而言的一個概念，屬于民事賠償范圍。2、對權利主體的要求不同，誤工費要求受害人的收入能力和水平差異較大，而工傷職工在停工留薪期內都可以獲得停工留薪工資。3、兩者包含的項目不同。誤工費包括：工資(包含全日制工作收入和兼職工作收入)、資金、津貼、課酬停工留薪工資僅包括停工留薪期間內的工資。4、兩者的時間計算方式不同，誤工費的時間限制根據實際造成的后果有限定的時間，停工留薪期一般不超過12個月。傷情嚴重或者情況特殊，經設區的市級勞動能力鑒定委員會確認，可以適當延長，但延長不得超過12個月。

《最高人民法院關于審理人身損害賠償案件適用法律若干問題的解釋》 第二十條 誤工費根據受害人的誤工時間和收入狀況確定。誤工時間根據受害人接受治療的醫療機構出具的證明確定。受害人因傷致殘持續誤工的，誤工時間可以計算至定殘日前一天。受害人有固定收入的，誤工費按照實際減少的收入計算。受害人無固定收入的，按照其最近三年的平均收入計算；受害人不能舉證證明其最近三年的平均收入狀況的，可以參照受訴法院所在地相同或者相近行業上一年度職工的平均工資計算。