事業單位的自用地一般不能免征稅款，在城市、縣城、建制鎮、工礦區范圍內使用土地的事業單位，屬于城鎮土地使用稅的納稅人。土地使用稅以土地使用證確認的面積為計稅依據，自取得土地使用權開始分期繳納，每年繳納一次。法律依據：《城鎮土地使用稅暫行條例》第二條 在城市、縣城、建制鎮、工礦區范圍內使用土地的單位和個人，為城鎮土地使用稅（以下簡稱土地使用稅）的納稅人，應當依照本條例的規定繳納土地使用稅。前款所稱單位，包括國有企業、集體企業、私營企業、股份制企業、外商投資企業、外國企業以及其他企業和事業單位、社會團體、國家機關、軍隊以及其他單位；所稱個人，包括個體工商戶以及其他個人。 第八條 土地使用稅按年計算、分期繳納。繳納期限由省、自治區、直轄市人民政府確定。 第九條 新征用的土地，依照下列規定繳納土地使用稅： （一）征用的耕地，自批準征用之日起滿1年時開始繳納土地使用稅； （二）征用的非耕地，自批準征用次月起繳納土地使用稅。