企業并購審計的風險主要包括：
1、不可控風險。例如，政府行為、公眾行為等不可抗力導致的風險；
2、違法風險。例如，并購時未及時通知債權人申報債權，或損害其他股東優先購買權等情形；
3、財務風險。例如，并購前，未就并購主體進行調研，收購方存在經營困難等問題，不可能或難以履行后續的付款義務等其他風險。法律依據：《中華人民共和國公司法》第一百七十二條 公司合并可以采取吸收合并或者新設合并。 一個公司吸收其他公司為吸收合并，被吸收的公司解散。兩個以上公司合并設立一個新的公司為新設合并，合并各方解散。 第一百七十三條 公司合并，應當由合并各方簽訂合并協議，并編制資產負債表及財產清單。公司應當自作出合并決議之日起十日內通知債權人，并于三十日內在報紙上公告。債權人自接到通知書之日起三十日內，未接到通知書的自公告之日起四十五日內，可以要求公司清償債務或者提供相應的擔保。 第一百七十四條 公司合并時，合并各方的債權、債務，應當由合并后存續的公司或者新設的公司承繼。