工程合同會引起的糾紛有：分包合同糾紛、監理合同糾紛、勘察合同糾紛、設計合同糾紛、施工合同糾紛、價款優先受償權糾紛、工程質量糾紛、工期糾紛等。

法律依據：

《民法典》第七百八十八條

建設工程合同是承包人進行工程建設，發包人支付價款的合同。建設工程合同包括工程勘察、設計、施工合同。

第七百九十四條

勘察、設計合同的內容一般包括提交有關基礎資料和概預算等文件的期限、質量要求、費用以及其他協作條件等條款。

第七百九十五條

施工合同的內容一般包括工程范圍、建設工期、中間交工工程的開工和竣工時間、工程質量、工程造價、技術資料交付時間、材料和設備供應責任、撥款和結算、竣工驗收、質量保修范圍和質量保證期、相互協作等條款。

第七百九十六條

建設工程實行監理的，發包人應當與監理人采用書面形式訂立委托監理合同。發包人與監理人的權利和義務以及法律責任，應當依照本編委托合同以及其他有關法律、行政法規的規定。