工程結(jié)算單的有效期，首先看是否有約定的付款時(shí)間。如果有合同約定的付款時(shí)間，或者在結(jié)算單上有明確的付款時(shí)間，按照民法總則規(guī)定的訴訟時(shí)效期間，為3年，從應(yīng)付款時(shí)起算。如果沒有合同約定的付款時(shí)間，結(jié)算單上也沒有付款時(shí)間，則該結(jié)算單的有效期間，也就是訴訟時(shí)效期間仍然為3年，但起算時(shí)間從發(fā)包人拒付結(jié)算工程款開始起算。即訴訟時(shí)效從債權(quán)人知道或應(yīng)當(dāng)知道權(quán)利受到侵害時(shí)起算。工程欠款時(shí)效應(yīng)從建設(shè)單位應(yīng)付款而不付起算。但是如果工程結(jié)算單僅僅是整個工程的中間結(jié)算之一的，那么其有效期，從簽署之日起有效，但其訴訟時(shí)效期間，也就是其受到法律保護(hù)的期間，從最后一期付款期間屆滿時(shí)，再加上3年。

由于工程項(xiàng)目上存在很多管理不規(guī)范的現(xiàn)象，雙方的約定不明，因此，應(yīng)根據(jù)具體情況來逐一判定。

法律依據(jù)：

《中華人民共和國民法總則》第一百八十八條

向人民法院請求保護(hù)民事權(quán)利的訴訟時(shí)效期間為三年。法律另有規(guī)定的，依照其規(guī)定。

訴訟時(shí)效期間自權(quán)利人知道或者應(yīng)當(dāng)知道權(quán)利受到損害以及義務(wù)人之日起計(jì)算。法律另有規(guī)定的，依照其規(guī)定。但是自權(quán)利受到損害之日起超過二十年的，人民法院不予保護(hù);有特殊情況的，人民法院可以根據(jù)權(quán)利人的申請決定延長。