駕駛證被扣12分后發生交通事故的保險要賠償。根據規定，駕駛證被扣12分不是交強險的免賠范圍，對于被保險機動車發生道路交通事故造成本車人員、被保險人以外的受害人人身傷亡、財產損失的，應當由保險公司依法在機動車交通事故責任強制保險責任限額范圍內予以賠償。

法律依據：

《機動車交通事故責任強制保險條例》第二十二條

有下列情形之一的，保險公司在機動車交通事故責任強制保險責任限額范圍內墊付搶救費用，并有權向致害人追償：

（一）駕駛人未取得駕駛資格或者醉酒的；

（二）被保險機動車被盜搶期間肇事的；

（三）被保險人故意制造道路交通事故的。

有前款所列情形之一，發生道路交通事故的，造成受害人的財產損失，保險公司不承擔賠償責任。