由于甲方原因停工的乙方可以依法索賠，雙方可以經協商一致簽訂索賠協議書。因發包人原因造成工程停工的，發包人要承擔賠償承包人因此造成的停工、窩工、倒運、機械設備調遷、材料和構件積壓等損失和實際費用的責任。就賠償問題雙方可以協商，如果協商不成的，承包人可以向法院起訴索賠。

《中華人民共和國民法典》

第八百零四條 因發包人的原因致使工程中途停建、緩建的，發包人應當采取措施彌補或者減少損失，賠償承包人因此造成的停工、窩工、倒運、機械設備調遷、材料和構件積壓等損失和實際費用。

第八百零五條 因發包人變更計劃，提供的資料不準確，或者未按照期限提供必需的勘察、設計工作條件而造成勘察、設計的返工、停工或者修改設計，發包人應當按照勘察人、設計人實際消耗的工作量增付費用。