如果是宅基地權屬糾紛，應該先到鄉鎮人民政府或縣級國土資源部門進行處理，對處理的決定不服經過行政復議后，方可行政訴訟，應到縣級人民法院。若是宅基地權屬清楚、可以直接向宅基地所在地的縣級人民法院提起訴訟。

《中華人民共和國土地管理法》 第十六條 土地所有權和使用權爭議 由當事人協商解決商不成的 由人民政府處理。單位之間的爭議 由縣級以上人民政府處理人之間個人與單位之間的爭議 由鄉級人民政府或者縣級以上人民政府處理。當事人對有關人民政府的處理決定不服的 可以自接到處理決定通知之日起三十日內 向人民法院起訴。在土地所有權和使用權爭議解決前 任何一方不得改變土地利用現狀。根據該規定 因宅基地發生糾紛需要到鄉鎮人民政府或者到縣級人民政府申請確權 兩級政府都是可以的。