違法。公司拖欠工資，員工收貨款抵工資違法。公司拖欠員工工資，員工應當通過合法的途徑追討，可以向工會求助，可以向勞動監察投訴，可以申請勞動爭議仲裁，有欠條的可以直接向人民申請支付令。對公司的貨款，員工沒有處分權。員工私自扣下貨款，是違法行為，是利用職務之便，把公司的財產據為己有，從而強迫公司清償工資，如果員工不是及時知會公司，或者扣款多余拖欠的額度，則可能構成職務侵占。

《工資支付暫行規定》 第七條 工資必須在用人單位與勞動者約定的日期支付。如遇節假日或休息日，則應提前在最近的工作日支付。工資至少每月支付一次，實行周、日、小時工資制的可按周、日、小時支付工資。

《中華人民共和國勞動合同法》

第三十條 用人單位應當按照勞動合同約定和國家規定，向勞動者及時足額支付勞動報酬。用人單位拖欠或者未足額支付勞動報酬的，勞動者可以依法向當地人民申請支付令，人民應當依法發出支付令。

第八十五條 用人單位有下列情形之一的，由勞動行政部門責令限期支付勞動報酬、加班費或者經濟補償；勞動報酬低于當地最低工資標準的，應當支付其差額部分；逾期不支付的，責令用人單位按應付金額百分之五十以上百分之一百以下的標準向勞動者加付賠償金：

1、未按照勞動合同的約定或者國家規定及時足額支付勞動者勞動報酬的；

2、低于當地最低工資標準支付勞動者工資的；3、安排加班不支付加班費的；

4、解除或者終止勞動合同，未依照本法規定向勞動者支付經濟補償的。