注銷營業(yè)執(zhí)照，股東不配合，不會影響注銷的進程。注銷營業(yè)執(zhí)照，主要是由法人代表進行。當公司經(jīng)營管理發(fā)生嚴重困難，繼續(xù)存續(xù)會使股東利益受到重大損失，通過其他途徑不能解決的，持有公司全部股東表決權(quán)百分之十以上的股東，可以請求人民法院解散公司。股權(quán)的登記與否的，在形式要件作用下，會產(chǎn)生善意第三人能否對當事人主張權(quán)利的影響。

《中華人民共和國公司登記管理條例》第四十二條 有下列情形之一的，公司清算組應(yīng)當自公司清算結(jié)束之日起30日內(nèi)向原公司登記機關(guān)申請注銷登記：1、公司被依法宣告破產(chǎn)；2、公司章程規(guī)定的營業(yè)期限屆滿或者公司章程規(guī)定的其他解散事由出現(xiàn)，但公司通過修改公司章程而存續(xù)的除外；3、股東會、股東大會決議解散或者一人有限責任公司的股東、外商投資的公司董事會決議解散；4、依法被吊銷營業(yè)執(zhí)照、責令關(guān)閉或者被撤銷；5、人民法院依法予以解散；6、法律、行政法規(guī)規(guī)定的其他解散情形。