農村低保戶不用交合作醫療，由當地民政府統一支付費用給合作醫療的。當地村上有低保戶名單，每年提供給衛生院，錄取合作醫療系統。根據規定，有5類人群可以免交農村合作醫療。分別如下：農村80歲以上高齡老人、農村的殘疾人、農村的特別貧困戶、農村的低保戶和五保戶、計劃生育特殊家庭。

《中華人民共和國精神衛生法》 第六十八條 縣級以上人民政府衛生行政部門應當組織醫療機構為嚴重精神障礙患者免費提供基本公共衛生服務。精神障礙患者的醫療費用按照國家有關社會保險的規定由基本醫療保險基金支付。醫療保險經辦機構應當按照國家有關規定將精神障礙患者納入城鎮職工基本醫療保險、城鎮居民基本醫療保險或者新型農村合作醫療的保障范圍。縣級人民政府應當按照國家有關規定對家庭經濟困難的嚴重精神障礙患者參加基本醫療保險給予資助。醫療保障、財政等部門應當加強協調，簡化程序，實現屬于基本醫療保險基金支付的醫療費用由醫療機構與醫療保險經辦機構直接結算。精神障礙患者通過基本醫療保險支付醫療費用后仍有困難，或者不能通過基本醫療保險支付醫療費用的，醫療保障部門應當優先給予醫療救助。