主合同和擔保合同發(fā)生糾紛，首先是根據(jù)主合同確定案件管轄。如果債權人向承擔連帶責任的擔保人主張權利的，則應由擔保人住所地法院管轄。 主合同與擔保合同在效力上有以下關聯(lián)：擔保合同的產(chǎn)生基礎是主合同。若主合同被認定為無效合同的，擔保合同也會隨之無效。但相關法律對此另有規(guī)定的，按照特殊規(guī)定處理。

《中華人民共和國民法典》第三百八十八條 設立擔保物權，應當依照本法和其他法律的規(guī)定訂立擔保合同。擔保合同包括抵押合同、質(zhì)押合同和其他具有擔保功能的合同。擔保合同是主債權債務合同的從合同。主債權債務合同無效的，擔保合同無效，但是法律另有規(guī)定的除外。 擔保合同被確認無效后，債務人、擔保人、債權人有過錯的，應當根據(jù)其過錯各自承擔相應的民事責任。