外地就醫的農村合作醫療在參保地醫保申請批準后可以報銷。在外地住院就醫時，需要先向參保地醫保提出申請，批準了以后可以報銷，否則參保地是不給報銷的。參保地批準以后帶上住院的病歷、住院的發票、費用清單、疾病診斷書、出院的小結、身份證、戶口本和合作醫療本及轉院的手續這些資料到指定的報銷醫院的醫保結算窗口進行報銷。

《中華人民共和國社會保險法》 第五十八條 用人單位應當自用工之日起三十日內為其職工向社會保險經辦機構申請辦理社會保險登記。未辦理社會保險登記的，由社會保險經辦機構核定其應當繳納的社會保險費。自愿參加社會保險的無雇工的個體工商戶、未在用人單位參加社會保險的非全日制從業人員以及其他靈活就業人員，應當向社會保險經辦機構申請辦理社會保險登記。國家建立全國統一的個人社會保障號碼。個人社會保障號碼為公民身份號碼。