建設工程竣工驗收的程序是：施工單位向建設單位提交申請驗收報告，然后建設單位組織設計、施工各單位組成驗收小組進行驗收，并出具驗收意見，之后按驗收結果支付工程款或要求修理、重作等。法律依據：《中華人民共和國建筑法》第五十八條 建筑施工企業對工程的施工質量負責。 《中華人民共和國建筑法》第五十九條 建筑施工企業必須按照工程設計要求、施工技術標準和合同的約定，對建筑材料、建筑構配件和設備進行檢驗，不合格的不得使用。 《中華人民共和國建筑法》第六十一條 交付竣工驗收的建筑工程，必須符合規定的建筑工程質量標準，有完整的工程技術經濟資料和經簽署的工程保修書，并具備國家規定的其他竣工條件。建筑工程竣工經驗收合格后，方可交付使用；未經驗收或者驗收不合格的，不得交付使用。