合同糾紛法院的立案程序如下：
1、由當事人向法院遞交起訴狀、副本和相應的證據材料；
2、由法院進行審查，如果審查符合起訴條件的，就受理立案；
3、如果不符合的，就不予受理，作出不予受理裁定書。法律依據：《中華人民共和國民事訴訟法》第一百二十條 起訴應當向人民法院遞交起訴狀，并按照被告人數提出副本。書寫起訴狀確有困難的，可以口頭起訴，由人民法院記入筆錄，并告知對方當事人。 《中華人民共和國民事訴訟法》第一百二十三條 人民法院應當保障當事人依照法律規定享有的起訴權利。對符合本法第一百一十九條的起訴，必須受理。符合起訴條件的，應當在七日內立案，并通知當事人；不符合起訴條件的，應當在七日內作出裁定書，不予受理；原告對裁定不服的，可以提起上訴。 《中華人民共和國民事訴訟法》第一百四十八條 人民法院對公開審理或者不公開審理的案件，一律公開宣告判決。當庭宣判的，應當在十日內發送判決書；定期宣判的，宣判后立即發給判決書。宣告判決時，必須告知當事人上訴權利、上訴期限和上訴的法院。