未結算工程的處理通常情況下要從兩個角度來看，

從發包方或業主的角度來看，工程是否結算不影響工程的合法性，因為判斷工程的合法性通常是以建設用地規劃許可證、建設工程規劃許可證為依據。雖然，未結算不影響工程的合法性，但是可能存在不能竣工驗收，不能交付使用，這可能會影響業主的權利。為此，發包方或業主也應該及時結算，以免產生糾紛。

從承包方或施工人的角度來看，工程未結算會影響工程款的支付，對于承包方或施工人債權的實現存在障礙，資金壓力會很大，為此，承包方或施工人應該積極主張要求發包方或業主進行結算，如果不配合結算，盡快提起訴訟，主張權利，當然在未移交工程的情況下，需要保護好完工工程，以免影響竣工驗收和結算。

法律依據：

《建設工程價款結算暫行辦法》第二十條

當事人對工程造價發生合同糾紛時，可通過下列辦法解決：

(一)雙方協商確定;

(二)按合同條款約定的辦法提請調解;

(三)向有關仲裁機構申請仲裁或向人民法院起訴。