無論分居多久都不會自動離婚，只有協議離婚和訴訟離婚兩種方式解除婚姻關系，孩子的撫養權可由雙方協商決定，協商不一致的，由人民法院根據雙方的各方面條件，判決更適合小孩身心健康成長的一方撫養。

法律依據：

《中華人民共和國民法典》第一千零七十六條

夫妻雙方自愿離婚的，應當簽訂書面離婚協議，并親自到婚姻登記機關申請離婚登記。

離婚協議應當載明雙方自愿離婚的意思表示和對子女撫養、財產以及債務處理等事項協商一致的意見。

第一千零七十九條

夫妻一方要求離婚的，可以由有關組織進行調解或者直接向人民法院提起離婚訴訟。

人民法院審理離婚案件，應當進行調解；如果感情確已破裂，調解無效的，應當準予離婚。

第一千零八十四條

離婚后，不滿兩周歲的子女，以由母親直接撫養為原則。已滿兩周歲的子女，父母雙方對撫養問題協議不成的，由人民法院根據雙方的具體情況，按照最有利于未成年子女的原則判決。子女已滿八周歲的，應當尊重其真實意愿。