建筑工程設計合作協議的內容是：甲乙雙方的基本信息；工程名稱，規模，投資額，建設地點；甲乙雙方的權利與義務；設計的修改和停止；施工組織設計和工期；設計費的數量和交付辦法；獎勵與違約責任。法律依據：《民法典》第七百七十一條 承攬合同的內容一般包括承攬的標的、數量、質量、報酬，承攬方式，材料的提供，履行期限，驗收標準和方法等條款。 第七百九十五條 施工合同的內容一般包括工程范圍、建設工期、中間交工工程的開工和竣工時間、工程質量、工程造價、技術資料交付時間、材料和設備供應責任、撥款和結算、竣工驗收、質量保修范圍和質量保證期、相互協作等條款。