發生擔保公司貸款糾紛的一般屬于民事糾紛。民事糾紛是公民之間、法人之間、其他組織之間以及他們相互之間因財產關系和人身關系而產生的糾紛。發生民事糾紛的，當事人可以依法向法院起訴，由法院來裁決。法律依據：《中華人民共和國民事訴訟法》第三條 人民法院受理公民之間、法人之間、其他組織之間以及他們相互之間因財產關系和人身關系提起的民事訴訟，適用本法的規定。 第二十三條 因合同糾紛提起的訴訟，由被告住所地或者合同履行地人民法院管轄。 第三十四條 合同或者其他財產權益糾紛的當事人可以書面協議選擇被告住所地、合同履行地、合同簽訂地、原告住所地、標的物所在地等與爭議有實際聯系的地點的人民法院管轄，但不得違反本法對級別管轄和專屬管轄的規定。