由于承辦法官不具備有關工程造價方面的專業知識，對鑒定所需證據材料及鑒定意見的內容和公正性、準確性無法完全審查，在司法實踐中，往往就是將所有的工程材料統統交給鑒定機構，并依據鑒定機構出具的鑒定意見徑行做出判決，有的審判法官甚至會認為只能根據鑒定意見來判決，這種以鑒代審的狀況實際上嚴重干擾或影響了法官對案件事實的獨立裁判權，可能導致建設工程糾紛案件判決結果的不公，當事人意見大，服判息訴率低,總之，在建設工程糾紛的工程造價鑒定中，法院無力監督管理鑒定進程，鑒定機構主管部門無心監督鑒定過程，使工程造價鑒定進展困難，鑒定意見遲遲不能出具，嚴重拖延了此類案件的審理期限。