夫妻分居已滿兩年婚姻不會自動解除。想要解除婚姻關系需要去婚姻登記機關辦理離婚手續或者拿到法院判離的判決書。雙方都同意離婚的，可以簽訂離婚協議書，然后去婚姻登記機關辦理離婚手續，領取離婚證。

法律依據：

《民法典》第一千零七十九條

夫妻一方要求離婚的，可以由有關組織進行調解或者直接向人民法院提起離婚訴訟。

人民法院審理離婚案件，應當進行調解；如果感情確已破裂，調解無效的，應當準予離婚。

有下列情形之一，調解無效的，應當準予離婚：

（一）重婚或者與他人同居；

（二）實施家庭暴力或者虐待、遺棄家庭成員；

（三）有賭博、吸毒等惡習屢教不改；

（四）因感情不和分居滿二年；

（五）其他導致夫妻感情破裂的情形。

第一千零七十六條

夫妻雙方自愿離婚的，應當簽訂書面離婚協議，并親自到婚姻登記機關申請離婚登記。

離婚協議應當載明雙方自愿離婚的意思表示和對子女撫養、財產以及債務處理等事項協商一致的意見。