承包人可以申請的施工索賠有：指令錯誤造成的損失；未按合同時間提供圖紙造成的損失；延期開工或暫停施工造成的損失；沒有完全履行告知義務導致地址條件發生變化造成的損失；對工程質量的檢驗影響施工正常進行造成的損失；沒有按照合同時間支付工程預付款和進度款造成的損失；供應的材料設備不合格造成的損失。

法律依據：

《民法典》第八百零一條

因施工人的原因致使建設工程質量不符合約定的，發包人有權請求施工人在合理期限內無償修理或者返工、改建。經過修理或者返工、改建后，造成逾期交付的，施工人應當承擔違約責任。

第八百零二條

因承包人的原因致使建設工程在合理使用期限內造成人身損害和財產損失的，承包人應當承擔賠償責任。

第八百零三條

發包人未按照約定的時間和要求提供原材料、設備、場地、資金、技術資料的，承包人可以順延工程日期，并有權請求賠償停工、窩工等損失。